Php es un poderoso lenguaje de script, permite a su usuario tener bastante control sobre el sistema y a atacantes maliciosos muchas opciones de alcanzar su objetivo.
Un administrador de sistemas no debe suponer que un sistema es completamente seguro con solo tener las actualizaciones de seguridad instaladas, un sistema que muestra código al exterior no es seguro, aunque el resultado sea HTML, se expone a ataques de formas muy diversas y a fallos de seguridad desconocidos.
Limitar al máximo el acceso que permite php es entonces una necesidad.